Retten til at fiske ved Gudenåen ejes af de mange lodsejere på strækningen. For at få tilladelse til at fiske ved Gudenåen, skal der med få undtagelser købes fiskekort hos den lokale fiskeriforening.
Fiskekort til strækningen mellem Tørring og Aastedbro skal erhverves gennem Horsens og Omegns Sportsfiskerforening, som har retten til næsten hele strækningen. Du har mulighed for at købe dagskort til en stykke mellem Uldum Kær til hvor Gudenåen møder Raskvej lidt syd for Åle.
Længere mod nord, ved Mossø, har Silkeborg Fiskeriforening fiskeretten ved søens vestlige bred. Overnatter du på kanolejrpladsen ved Klostermølle, kan du fiske i åen på pladsens areal ved at købe fiskeret af opsynsmanden.